Az e-útlevél hátsó borítójába egy chip került, amely alkalmas arra, hogy az okmány birtokosának biometrikus jellemzőit tárolja. Az e-útlevél fedőlapjának színe burgundivörösre változott, illetve megjelent a fedőlapon az "Európai Unió" felirat és a chip jelenlétére utaló nemzetközi jelzés.
Az e-útlevél az Európai Unió összes hivatalos nyelvén tartalmazza az útlevélben szereplő legfontosabb kifejezéseket.
Ezen változások kizárólag a 2006. augusztus 29-e után kérelmezett új e-útlevelekre vonatkoznak. A jelzett időpont előtti útlevelek érvényességét az új e-útlevél kibocsátása nem érinti, azok lejáratukig érvényben maradnak.
A tizenkét éven aluliak útlevelébe a jövőben nem kell ujjlenyomatot venni az EU-ban – így döntött legutóbbi ülésén az Európai Parlament,tekintettel, arra, hogy a kísérleti időszakban az illetékes hatóságok azt tapasztalták, hogy a gyerekek ujjlenyomata nem megfelelő minőségű, ráadásul gyermekkorban az ujjlenyomat még változik, ami megnehezíti annak ellenőrzését az útlevél érvényességének teljes időtartama alatt. Éppen ezért az Európai Bizottság tervezete már azt javasolta, hogy a 12 éven aluliak ez alól mentességet élvezzenek. Az EP jelentéstevője és a tanácsi elnökség egyetértett a felvetéssel; igaz, azok az országok, melyek jelenleg is ujjlenyomatot vesznek a tizenkét év alattiaktól, a rendelet hatályba lépését követően négy évig még megtehetik ezt. A hat évnél fiatalabbaktól azonban egyáltalán nem lehet majd ujjlenyomatot venni.
Ez Európa Tanács ugyanakkor leszögezi azt is, hogy a gyermekkereskedelem és -csempészet elleni harc jegyében a tizenkét éven aluliaknak továbbra is rendelkezniük kell saját úti okmánnyal.
A tagállamok még a 2001. szeptember 11-i terrortámadásokat követően kérték azt a Bizottságtól, hogy szigorítsa a dokumentumok biztonságát. Az EU ezt követően döntött arról, hogy ezen okmányoknak biometrikus adatokat is tartalmazniuk kell. A biometrikus útlevelet az Európai Unióban, továbbá Izlandon, Norvégiában, valamint Svájcban egységesen idén június 29-én vezetik be.
Azokban az esetekben, amikor fizikailag nem lehet ujjlenyomatot venni, a tagállamok egy maximum tizenkét hónapig érvényes ideiglenes útlevelet is kibocsáthatnak.
Bauer Edit szlovákiai néppárti képviselő a plenáris vitában ugyanakkor sajnálatosnak nevezte, hogy nem került bele az egyeztetett javaslatba az, hogy a kiskorúak útlevele a saját személyes adatokon kívül tartalmazza az értük felelősséggel tartozó személyeknek vagy személynek az adatait.