Munkássága középpontjában az a merész feltételezés állt, hogy a történelem előtti időkben idegen civilizációk érkeztek a bolygónkra, segítve az emberi kultúrák virágzását. Noha az akadémiai világ elméleteit a spekulatív vagy áltudományos kategóriába sorolta, hatása letagadhatatlan: könyvei és filmjei alapjaiban határozták meg az ufókutatást és a modern sci-fit. Tisztelői világszerte az úttörőt gyászolják benne, aki más megvilágításba helyezte az emberiség múltját. Giorgio A. Tsoukalos, az Ancient Aliens sztárja is megemlékezett róla, hangsúlyozva, hogy Däniken munkássága örökre megváltoztatta a paleoasztronautika tudományágát.