A legjobb 16 között kapcsolódik be a küzdelmekbe a 2011/2012-es férfi NB I első négy helyezettje, azaz az MKB Veszprém, a Pick Szeged, a Balatonfüred és a Csurgó is.
A nyolcaddöntőktől kezdve a Nemzetközi Kézilabda Szövetség szabályzata alapján a férfi és a női Magyar Kupában egy mérkőzésen egy csapat három alkalommal kérhet időt.
A férfi Magyar Kupa nyolcaddöntőinek párosítása:
Csurgói KK-Ceglédi KKSE (2012. november 28. 18:00)
B.Braun Gyöngyös-Balatonfüredi KC (2012. november 28. 18:00)
Balassagyarmati Kábel SE-Kőnig Trade Balmazújváros (2012. december 8. 17:00)
Százhalombattai KE-Grundfos Tatabánya KC (2012. december 12. 18:00)
Mezőkövesdi KC-Tatai AC (2012. december 12. 18:00)
SZESE Győr-MKB Veszprém KC (2012. december 12. 18:30)
Kalocsai KC-Nyíregyháza Nyír Komplett Pick Szeged-Váci KSE
A hivatalos játéknap 2012. december 12.
A további program:
Negyeddöntők:
1. mérkőzések: 2012. január 30.
Visszavágók: 2012. március 6.
Négyes döntő: 2012. április 13-14.